Usagi Yojimbo (magyarul: nyúltestőr) története a XVII. század végén játszódik Japánban. A polgárháború éppen hogy véget ért, a sógun még nem tudta megszilárdítani a hatalmát. Az anarchia és a politikai cselszövések korának végén járunk.
Egy urát vesztett szamuráj, egy rónin bolyong ebben az országban, a neve Mijamoto Usagi. A sorozat 24. kötetében egy régi rejtélyre, Dzsei, a démoni lélek eredetére derül fény.